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Yugi rêve que lui et son alter-égo Yami combattent un nouvel ennemi. À son réveil, alors qu'il part pour l'école, il remarque que son grand-père n'est toujours pas revenu de son voyage. Pendant que lui et Téa jouent à un nouveau jeu, Les Monstres à Capsules, Joey qui est toujours très chanceux participe à une loterie et gagne 4 billets pour l'Inde. C'est ainsi que Yugi, Tea, Joey et Tristan partent pour l'Inde mais le second avion qu'ils prennent tombe en panne et s'écrase en pleine forêt.
Là-bas, ils sauvent de la déshydratation un homme du nom d'Alex Brisbane, un collègue du grand-père de Yugi. Il leur apprend que Salomon Muto a disparu dans une pyramide et les conduit au lieu de la disparition. arrivés sur place, ils découvrent un lieu truffé de pièges en tout genre puis Joey disparaît a son tour, Yugi et ses amis suivent sa trace pour le retrouver. Arrivé dans une forêt, ils se font attaquer par un monstre et découvrent qu'ils sont tombés dans un monde alternatif, dans ce monde ils devront utiliser la méthode d'invocation du jeu Capsule Monsters pour combattre les monstres.
Arriveront-ils à retrouver Joey et le grand-père de Yugi ainsi qu'à quitter ce monde ?